Les laboratoires médicaux sont des lieux de travail potentiellement dangereux en raison des risques chimiques, électriques, mécaniques, physiques mais surtout biologiques. Dès lors, il importe de minimiser systématiquement chacun des risques dans le laboratoire. Une méthode pour y parvenir consiste à élaborer des procédures définissant les pratiques sans risque, par exemple, des procédures pour la manipulation sans risque des échantillons, des règles de sécurité pour le personnel et les visiteurs dans le bâtiment, des procédures pour la manipulation sans risque de l'équipement, etc. La sécurité des manipulations de micro-organismes en laboratoire doit également être garantie.

La norme ISO 15189 comporte uniquement une obligation de sécurité, stipulant simplement que le laboratoire doit être sûr et se conformer aux bonnes pratiques et aux règles applicables. Le personnel doit y consacrer beaucoup de temps et recevoir une formation spécialisée. Le processus de contrôle et d'amélioration de la sécurité du laboratoire nécessite une bonne coordination. Un responsable de la sécurité biologique doit être désigné à cet effet.

Dans la colonne de droite, figure un lien vers le chapitre Sécurité biologique en laboratoire du manuel Système de gestion de la qualité au laboratoire (LQMS) de l'OMS. Ce document fournit une information aisément lisible et compréhensible sur tous les aspects de la sécurité en lien avec la pratique en laboratoire et tous les membres du personnel du laboratoire devraient le lire. L'OMS a également publié un manuel de sécurité biologique en laboratoire. Il fournit des informations plus spécifiques sur la sécurité biologique en laboratoire et le responsable de la sécurité biologique doit le lire.